Organet e FSHGJ-së janë:
- Asambleja e Përgjithshme është organi më i lartë vendimmarrës.
- Komiteti Drejtues është organi më i lartë ekzekutiv
- Sekretariati i përgjithshëm është organ administrativ.
Pranë FSHGJ-së funksionojnë komisione për përmbushjen e qëllimit dhe funksionimit të saj.
Komisionet janë :
Komisioni Teknik dhe i Gjykimit
Komisioni i Financës
Komisioni i Disiplinë
Komisioni i Apelit
Komisioni i Garave